Ежегодные конкурсы научных работ проводятся в институте с 1994 года. Победителям этих конкурсов присуждаются премии, статус которых определяется положениями, принятыми Ученым советом института. Десяти лучшим работам, из числа представленных на общеинститутский конкурс научными отделениями, присуждается Премия ФТИ.

До 1998 года существовал следующий тур конкурса, базирующийся на результатах представления десяти лучших работ на специальном заседании Ученого совета. Одна из них удостаивалась высшей награды института тех лет — Премии Ученого совета. Этот тур конкурса был отменен после появления именных премий.

Именные премии, учрежденные в знак признания заслуг и в память выдающихся физиков А.Ф. Иоффе, Я.И. Френкеля и Б.П. Константинова, научная деятельность которых была неразрывно связана с институтом, присуждаются с 1999 года. В 2009 году была учреждена, а с 2010 года стала присуждаться еще одна премия — премия имени В.М. Тучкевича. Порядок присуждения именных премий регламентируется соответствующими положениями.

Специальные премии установлены за работы, выполненные молодыми учеными ФТИ.

Порядок присуждения именных и специальных премий регламентируется соответствующими положениями.

Перечни премированных работ, упорядоченные по виду премии, представлены в последующих подразделах.